根据你的程序,是不是就是要一个这样的功能:
> 开头的行略去。
不是的行一肯只含有 agtc 这四个字母,数一数就行了?
这个东西能慢到哪去呀。你上传个数据实例我测测呗。
[ 本帖最后由 pangding 于 2011-7-1 16:40 编辑 ]
> 开头的行略去。
不是的行一肯只含有 agtc 这四个字母,数一数就行了?
这个东西能慢到哪去呀。你上传个数据实例我测测呗。
[ 本帖最后由 pangding 于 2011-7-1 16:40 编辑 ]
2011-07-01 16:05
程序代码:[home@cpp]cat input_file.txt >header_1 ACGTGAGAGATAGAGC >header_2 AGATGAGATGAGAGATAGA . .
程序代码:
[home@cpp]awk '$0!~">"{total += length($1)}END{print total}' input_file.txt > output_file.txt
[home@cpp]cat output_file.txt
35
2011-07-01 17:20
程序代码:[home@cpp]cat input_file.txt >header_1 ACGTGAGAGATAGAGC >header_2 AGATGAGATGAGAGATAGA . .
程序代码:
[home@cpp]awk '$0!~">"{total += length($1)}END{print total}' input_file.txt > output_file.txt
[home@cpp]cat output_file.txt
35

2011-07-01 17:27

2011-07-01 20:39
程序代码:>header_1 ACGTGAGAGATAGAGC >header_2 AGATGAGATGAGAGATAGA
35
2011-07-01 21:49
2011-07-01 22:49
2011-07-01 23:25
2011-07-01 23:56
2011-07-02 00:13
2011-07-02 00:21