标题:按位置信息在TXT中提取文件内容片段
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kingpop8
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按位置信息在TXT中提取文件内容片段
我的数据就是像这样,TTGCCGTCGCGGCGGATGGCCTGGCCGTTGGCGAGCAGGCAGTCGCCGGGCGCCACGACGCTGACGGTCCTGGGATCCAC
GGGCATCAGGGACCGGAAGTTGCCGCACATCAGGTGGATCCCCGAGATGGTGCAATGCCGGCTGCCGCTGCACTGGTTGG
AGACTGTCACCGTGTACGCCGACGTCCCGCTGCGGATCCCCCAGGCTCTGCATGATCACGAGGTCCTTTTGCACGTTGCA
GTGCCCGCCGCCATGGGCCGGCGCCGCGGGGGGCGGCGGGGGAGCCGGCTGCGCCGCCGCCAAGAGGAGGATGGTCATCG
AGGCTGCGAATGCCATGAGCCACGCCATGGAGATGGAGCTAGCGTTCGTCTTCATCGTCGGCGGAGGAGTTCTGAGACTT
GCTCGTATGTGCAGAAGCTAGTGGGTTAAGGCGAGCGATGCATCTATGTATACACGTATATACATGCATGTAATTTGGAA
TTGGTGTGGGTATTTGGAATGATCCGGATTTCTTTTGGCATGACGAGCGCCGGGAATTAAAGAAAGAAATTCTATTTCTT
ATTCCCATATGTAGCTAGCCCCGGCCAGAGGCCAGAAGTGGATGGAAATTACGCTCTTATCTTAGCTCTTCTTCGTATCT
TCTGATCCAACATCCAAGAACCTTTTAAGTCATTAAACTCTTGTTAGACTTAATCTCTTGTAAGTTCGGTTTAGATTCAG
GAATCGGCAAAGAAAAAAAAAATCGCTTCACACGTATTCCCTCCGTTTCTAAATAGTTGTTGCTATTTTAGTGCAGCACT
AAAACAACGACAAGTATTTAGAAACGGCGGGAGTAGTGTCTAATCAGGACTCTGTGGTCTAGTACACGATACGAGTATAT
ATACACACGGGCACGTAGGTTAAATTAGTTGATGTAACATAAAGAGTAAATCTATAATCTAGCTTCTTCTTCCTGGTAGC
TAGATCAGCCCGATCGTTCAAGCTGGCATGGACGCCGCCGACACCGATCACCCTGAAGCTTCTGGTGGACACGAAGGCGA
AGCGCGTGCTGTTCGCGGAGGCCGGCAAGGACGCCGTGGACTTCCTCCTGGCCCTCCTCACGCTGCCCGTCGGCACCGTC
GCCAAGCTGCTGCCTGACTCCGGCGTGGCCAACATCTACGCCAGCGCCGAGAGCCTGGACCCGGCGTACGTGCAGAGCGC
CGCCGTGCACGGCGCGCTGCTGAGAACCAACATGCCCTTGCTGCTGCGTCCCTGCTCGTATACTACTGCCCCGCCACGCC
GACAACGTCTTGGTACAGTGCGCCCCATCATCAGCTGGCCGC......(后略)
是个40m左右的txt文件,
    现在我有START和END位置信息,这里说的位置就是指的它在序列数据的第几个字母,也在txt文件里,像这样
                    start                end
1                 22965710           22968426
2                 47318273           47324388
3..   
现在就是想把start到end之间的文本用c语言一下提取出来,变成txt像下面这样存下来
>1
ATTCCCATATGTAGCTAGCCCCGGCCAGAGGCCAGAAGTGGATGGAAATTACGCTCTTATCTTAGCTCTTCTTCGTATCT
TCTGATCCAACATCCAAGAACCTTTTAAGTCATTAAACTCTTGTTAGACTTAATCTCTTGTAAGTTCGGTTTAGATTCAG
GAATCGGCAAAGAAAAAAAAAATCGCTTCACACGTATTCCCTCCGTTTCTAAATAGTTGTTGCTATTTTAGTGCAGCACT
AAAACAACGACAAGTATTTAGAAACGGCGGGAGTAGTGTCTAATCAGGACTCTGTGGTCTAGTACACGATACGAGTATAT
ATACACACGGGCACGTAGGTTAAATTAGTTGATGTAACATAAAGAGTAAATCTATAATCTAGCTTCTTCTTCCTGGTAGC
>2
TTGCCGTCGCGGCGGATGGCCTGGCCGTTGGCGAGCAGGCAGTCGCCGGGCGCCACGACGCTGACGGTCCTGGGATCCAC
GGGCATCAGGGACCGGAAGTTGCCGCACATCAGGTGGATCCCCGAGATGGTGCAATGCCGGCTGCCGCTGCACTGGTTGG
AGACTGTCACCGTGTACGCCGACGTCCCGCTGCGGATCCCCCAGGCTCTGCATGATCACGAGGTCCTTTTGCACGTTGCA
GTGCCCGCCGCCATGGGCCGGCGCCGCGGGGGGCGGCGGGGGAGCCGGCTGCGCCGCCGCCAAGAGGAGGATGGTCATCG
>3
......
因为要提取的片段大约有5000个 所以想要个程序
我初学C  但是急着要这个程序 在线等 谢谢~~~~·
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2010-07-28 16:54
kingpop8
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没有人会吗???就是读取一个.txt 按照位置信息提取字符串出来。
2010-07-29 09:13



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