#include<stdio.h>
int main()
{
    int i,j,n,temp;
    int a[6][6],b[6][6];
    for(i=0;i<3;i++)
        for(j=0;j<4;j++)
        scanf("%d",&a[i][j]);
        for(i=0;i<3;i++)
        {
            for(j=0;j<4;j++)
                printf("%d",a[i][j]);
            printf("\n");
        }
        for(i=0;i<4;i++)
            for(j=0;j<3;j++)
            {
            b[i][j]=a[j][i];
        
            }
   
    for(i=0;i<4;i++)
    {
        for(j=0;j<3;j++)
        printf("%d",b[i][j]);
        printf("\n");   

    }
    return 0;
}

你的程序没有错误啊   不过  这样写好麻烦   直接倒叙输出不就OK了   
下面一段代买  供你参考

#include<stdio.h>
int main()
{
    int i,j;
    int a[3][4];
    for(i=0;i<3;i++)
        for(j=0;j<4;j++)
            scanf("%d",&a[i][j]);
    for(i=0;i<3;i++)
    {
        for(j=0;j<4;j++)
            printf("%4d",a[i][j]);
        printf("\n");
    }
    for(j=0;j<4;j++)
    {
        for(i=0;i<3;i++)
            printf("%4d",a[i][j]);
        printf("\n");
    }
   
return 0;
} 

谢谢指导，最近才学的VC。